Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms