Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms