Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms