Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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