Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms