Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RNF185Q96GF1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms