Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms