Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E3Q969T4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms