Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHMTQ93088 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms