Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms