Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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