Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L2Q8NAA4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms