Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms