Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms