Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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