Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC141Q6ZP82 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms