Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCBE1Q6UXH8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCBE1Q6UXH8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCBE1Q6UXH8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCBE1Q6UXH8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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