Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC27A4Q6P1M0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms