Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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