Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BROXQ5VW32 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms