Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FREM1Q5H8C1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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