Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRT3Q5FWE3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms