Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms