Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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