Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00303Q3SY05 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms