Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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PTPRNQ16849 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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