Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms