Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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