Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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