Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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