Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP13Q15645 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIP13Q15645 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms