Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TCEA2Q15560 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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