Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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