Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NR1D2Q14995 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms