Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NFIXQ14938 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms