Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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