Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK13Q14004 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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