Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms