Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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