Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AP3B2Q13367 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms