Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCGQ13326 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms