Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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