Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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PRDM2Q13029 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM2Q13029 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
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