Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms