Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF2Q12933 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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