Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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