Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TROQ12816 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TROQ12816 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TROQ12816 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TROQ12816 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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