Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms