Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms