Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms